Система образования Новоаннинского муниципального района представлена 13 учреждениями дошкольного образования, 24 общеобразовательными учреждениями, 1 учреждением дополнительного образования детей.
Дошкольные учреждения посещают 738 воспитанников. 
На 1 сентября 2013 г. в 24 школах Новоаннинского муниципального района обучается 3537 человек. 2 школы являются базовыми, МКОУ Новоаннинская гимназия - ресурсным центром для обучения по профильным и углубленным программам.